Resumen
Los primeros bovinos llegaron a Costa Rica a finales del siglo XVI. Estos fueron principalmente animales Bos taurus ibéricos que posteriormente dieron origen al ganado criollo local. Las primeras importaciones de razas modernas se produjeron a mediados del siglo XIX, concretamente ganado Devonshire y Durham procedentes de Inglaterra, seguidas por importaciones posteriores de otras razas lecheras, como Holstein, Jersey y Ayrshire, a finales del mismo siglo. El ganado Bos indicus llegó recientemente a América, hace no más de 150 años, y fue introducido en Costa Rica a principios del siglo XX. La raza Brahman es hoy la más común en el país, junto con otras razas de cebú como Nelore, Gyr, Guzerá e Indubrasil. Debido a este origen diverso, la población bovina actual está genéticamente mezclada. Los modelos de mezcla genética pueden representar la composición genética de un individuo como una combinación de contribuciones de diferentes poblaciones ancestrales. El objetivo de este estudio fue modelar la estructura genética de la población bovina de Costa Rica comparando dos enfoques diferentes que utilizan modelos de mezcla genética: un escenario no supervisado, basado exclusivamente en datos de genotipo, y un escenario supervisado, que se basa en datos genéticos, asistidos además por información previa sobre el fenotipo y el propósito de producción. Se recolectaron y analizaron muestras de pelo de 1412 bovinos seleccionados al azar de 8 regiones de Costa Rica para detectar 18 marcadores microsatélites. El
análisis de datos se llevó a cabo mediante el programa STRUCTURE que se utiliza para investigar estructuras poblacionales mediante frecuencias alélicas de datos de genotipos multilocus para caracterizar grupos poblacionales y asignar individuos a esos grupos. El análisis de los datos genéticos
y la generación de clústeres (K) en ambos escenarios proporcionó resultados similares para K<5, aunque las estimaciones del modelo supervisado fueron más homogéneas y tuvieron desviaciones estándar más bajas. Las subpoblaciones definidas a priori se distribuyeron consistentemente entre los
grupos en ambos escenarios. La agrupación de subpoblaciones más probable se obtuvo para K=3, que separó principalmente las razas B. indicus, Jersey y otras razas B. taurus. Los tipos de razas se agruparon de manera concordante con la agrupación de razas a priori, lo que arroja información sobre la estructura genética de la población. Todos los tipos de raza a priori mostraron algún grado de mezcla en su composición genética, lo que revela que las así llamadas razas puras no son más que un término de consenso de tipos raciales que muestran una mayor proporción de marcadores que les ubican dentro de un clúster definido con propósitos y fenotipos similares, sin llegar a pertenecer enteramente a ese grupo, debido a la naturaleza de la composición mixta de sus genomas. La estructura genética obtenida de la combinación de mezcla más enfoque supervisado proporcionó los resultados más consistentes. Aquí obtuvimos la estructura genética de la población bovina de Costa Rica, a través de modelos de mezcla más enfoques supervisados o no supervisados, lo cual es un recurso valioso para agrupar individuos genéticamente relacionados dentro de esta población.
análisis de datos se llevó a cabo mediante el programa STRUCTURE que se utiliza para investigar estructuras poblacionales mediante frecuencias alélicas de datos de genotipos multilocus para caracterizar grupos poblacionales y asignar individuos a esos grupos. El análisis de los datos genéticos
y la generación de clústeres (K) en ambos escenarios proporcionó resultados similares para K<5, aunque las estimaciones del modelo supervisado fueron más homogéneas y tuvieron desviaciones estándar más bajas. Las subpoblaciones definidas a priori se distribuyeron consistentemente entre los
grupos en ambos escenarios. La agrupación de subpoblaciones más probable se obtuvo para K=3, que separó principalmente las razas B. indicus, Jersey y otras razas B. taurus. Los tipos de razas se agruparon de manera concordante con la agrupación de razas a priori, lo que arroja información sobre la estructura genética de la población. Todos los tipos de raza a priori mostraron algún grado de mezcla en su composición genética, lo que revela que las así llamadas razas puras no son más que un término de consenso de tipos raciales que muestran una mayor proporción de marcadores que les ubican dentro de un clúster definido con propósitos y fenotipos similares, sin llegar a pertenecer enteramente a ese grupo, debido a la naturaleza de la composición mixta de sus genomas. La estructura genética obtenida de la combinación de mezcla más enfoque supervisado proporcionó los resultados más consistentes. Aquí obtuvimos la estructura genética de la población bovina de Costa Rica, a través de modelos de mezcla más enfoques supervisados o no supervisados, lo cual es un recurso valioso para agrupar individuos genéticamente relacionados dentro de esta población.
Idioma original | Español |
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Páginas | 135 |
Estado | Publicada - oct 2024 |
Evento | Conservación de la Diversidad Biológica y Cultural de los Recursos Genéticos Animales para el Desarrollo Sostenible - Campus Tecnológico Local San Carlos, Alajuela, Costa Rica Duración: 21 oct 2024 → 26 oct 2024 |
Otros
Otros | Conservación de la Diversidad Biológica y Cultural de los Recursos Genéticos Animales para el Desarrollo Sostenible |
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Título abreviado | REGAD 2024 |
País/Territorio | Costa Rica |
Ciudad | Alajuela |
Período | 21/10/24 → 26/10/24 |
Palabras clave
- razas lecheras
- microsatélites
- filogenia
- conglomerados de similaridad